培養皿適用于防疫站、醫院、生物制品、食品工業、制藥工業等單位，用于細菌的分離培養、抗菌素效價檢驗和定性檢驗分析。在農業、水產等科學研究用于對種子發牙、植物、昆蟲、魚種的人工培養、孵化研究。電子工業或其它行業作為器皿使用。
使用培養皿的注意事項：
1.使用前經過清潔消毒，培養皿清潔與否對工作影響較大，可影響培養基的酸堿度，若有某些化學藥品的存在，會抑制細菌生長。
2.新購的培養皿應先用熱水沖洗，再置于質量分數為1%或2%的鹽酸溶液中浸泡數小時，使游離堿性物質除去，再用蒸餾水沖洗2次。
3.若要培養細菌，再用高壓蒸氣(一般6.8*10的5次方Pa高壓蒸氣)，120℃的溫度下30min滅菌，置室溫中干燥，或用干熱滅菌，就是將培養皿置于烘箱"烘箱內，溫度控制在120℃左右的情況下維持2h，即可殺死細菌的胞牙。
4.經過消毒的培養皿才能接種培養使用。
5.平版培養時為何把培養皿倒置。
培養時培養皿中會產生較多的水蒸氣，水蒸氣在皿蓋上凝結會產生水滴，如果培養皿正置，水滴滴下會將菌落沖散，這樣的話一個大菌落可能會分散開成為很多小菌落，對細菌的培養和計數都造成很大的麻煩。如果導致的話，培養基在上，皿蓋在下，水滴滴下不會滴到菌落上。
